Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chl1P70232 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chl1P70232 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chl1P70232 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chl1P70232 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chl1P70232 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chl1P70232 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chl1P70232 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Chl1P70232 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chl1P70232 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chl1P70232 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms