Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubb4bP68372 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb4bP68372 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms