Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acta1P68134 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms