Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UbdP63072 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UbdP63072 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UbdP63072 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UbdP63072 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UbdP63072 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UbdP63072 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UbdP63072 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UbdP63072 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UbdP63072 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UbdP63072 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UbdP63072 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UbdP63072 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UbdP63072 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UbdP63072 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UbdP63072 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UbdP63072 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UbdP63072 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UbdP63072 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UbdP63072 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UbdP63072 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
UbdP63072 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
UbdP63072 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UbdP63072 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms