Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3P62908 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps3P62908 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rps3P62908 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms