Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Lmo4P61969 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Lmo4P61969 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Lmo4P61969 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Lmo4P61969 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Lmo4P61969 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lmo4P61969 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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