Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ufm1P61961 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ufm1P61961 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms