Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnnP61807 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnnP61807 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnnP61807 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnnP61807 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnnP61807 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnnP61807 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnnP61807 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnnP61807 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnnP61807 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnnP61807 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnnP61807 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnnP61807 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnnP61807 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnnP61807 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SnnP61807 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnnP61807 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnnP61807 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnnP61807 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnnP61807 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnnP61807 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnnP61807 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnnP61807 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnnP61807 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnnP61807 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnnP61807 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnnP61807 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnnP61807 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnnP61807 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnnP61807 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnnP61807 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnnP61807 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnnP61807 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnnP61807 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SnnP61807 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SnnP61807 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnnP61807 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnnP61807 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnnP61807 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnnP61807 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnnP61807 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnnP61807 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnnP61807 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnnP61807 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnnP61807 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnnP61807 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnnP61807 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnnP61807 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnnP61807 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SnnP61807 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnnP61807 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnnP61807 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SnnP61807 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms