Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vbp1P61759 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms