Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga11P61622 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga11P61622 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Itga11P61622 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga11P61622 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Itga11P61622 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Itga11P61622 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms