Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snap25P60879 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snap25P60879 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snap25P60879 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms