Protein–RNA interactions for Protein: P60330

Espl1, Separin, mousemouse

Predictions only

Length 2,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Espl1P60330 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Espl1P60330 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Espl1P60330 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Espl1P60330 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Espl1P60330 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms