Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b6P59708 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b6P59708 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms