Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhbdl3P58873 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhbdl3P58873 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms