Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd4P58467 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd4P58467 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Setd4P58467 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd4P58467 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd4P58467 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms