Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dpf3P58269 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms