Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TdgP56581 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TdgP56581 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TdgP56581 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TdgP56581 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TdgP56581 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TdgP56581 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TdgP56581 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TdgP56581 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TdgP56581 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TdgP56581 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TdgP56581 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TdgP56581 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TdgP56581 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TdgP56581 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TdgP56581 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TdgP56581 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TdgP56581 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TdgP56581 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TdgP56581 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TdgP56581 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TdgP56581 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TdgP56581 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TdgP56581 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TdgP56581 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TdgP56581 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TdgP56581 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TdgP56581 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TdgP56581 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TdgP56581 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TdgP56581 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TdgP56581 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TdgP56581 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TdgP56581 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TdgP56581 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TdgP56581 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TdgP56581 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TdgP56581 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TdgP56581 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TdgP56581 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TdgP56581 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TdgP56581 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TdgP56581 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TdgP56581 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TdgP56581 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TdgP56581 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TdgP56581 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TdgP56581 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TdgP56581 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TdgP56581 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TdgP56581 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TdgP56581 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TdgP56581 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TdgP56581 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TdgP56581 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TdgP56581 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TdgP56581 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TdgP56581 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TdgP56581 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TdgP56581 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms