Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gp1bbP56400 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gp1bbP56400 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms