Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcd3P55096 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Abcd3P55096 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms