Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cux1P53564 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cux1P53564 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cux1P53564 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Cux1P53564 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cux1P53564 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux1P53564 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux1P53564 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux1P53564 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux1P53564 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux1P53564 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux1P53564 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux1P53564 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux1P53564 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux1P53564 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux1P53564 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cux1P53564 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cux1P53564 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cux1P53564 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cux1P53564 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cux1P53564 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cux1P53564 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cux1P53564 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cux1P53564 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cux1P53564 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cux1P53564 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cux1P53564 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cux1P53564 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms