Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfP51642 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfP51642 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfP51642 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfP51642 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfP51642 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfP51642 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CntfP51642 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfP51642 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfP51642 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfP51642 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfP51642 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfP51642 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfP51642 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfP51642 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfP51642 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfP51642 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfP51642 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfP51642 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfP51642 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CntfP51642 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CntfP51642 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CntfP51642 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CntfP51642 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CntfP51642 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CntfP51642 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CntfP51642 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CntfP51642 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfP51642 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfP51642 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfP51642 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfP51642 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfP51642 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfP51642 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfP51642 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfP51642 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfP51642 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfP51642 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfP51642 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfP51642 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfP51642 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfP51642 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfP51642 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfP51642 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfP51642 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CntfP51642 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms