Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs12P50716 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs12P50716 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs12P50716 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs12P50716 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs12P50716 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs12P50716 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs12P50716 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs12P50716 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs12P50716 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs12P50716 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa-rs12P50716 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa-rs12P50716 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa-rs12P50716 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa-rs12P50716 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa-rs12P50716 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa-rs12P50716 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa-rs12P50716 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa-rs12P50716 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa-rs12P50716 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms