Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SftpdP50404 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SftpdP50404 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SftpdP50404 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SftpdP50404 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SftpdP50404 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SftpdP50404 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SftpdP50404 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms