Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HpdP49429 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HpdP49429 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HpdP49429 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HpdP49429 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HpdP49429 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HpdP49429 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HpdP49429 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HpdP49429 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HpdP49429 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HpdP49429 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HpdP49429 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HpdP49429 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HpdP49429 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HpdP49429 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HpdP49429 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HpdP49429 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HpdP49429 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HpdP49429 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HpdP49429 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HpdP49429 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HpdP49429 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HpdP49429 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HpdP49429 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HpdP49429 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HpdP49429 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HpdP49429 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HpdP49429 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HpdP49429 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HpdP49429 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HpdP49429 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HpdP49429 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HpdP49429 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HpdP49429 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HpdP49429 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HpdP49429 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HpdP49429 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HpdP49429 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HpdP49429 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HpdP49429 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HpdP49429 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HpdP49429 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HpdP49429 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HpdP49429 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HpdP49429 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HpdP49429 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HpdP49429 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HpdP49429 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HpdP49429 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HpdP49429 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HpdP49429 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HpdP49429 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HpdP49429 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HpdP49429 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HpdP49429 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HpdP49429 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HpdP49429 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HpdP49429 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HpdP49429 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms