Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prox1P48437 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prox1P48437 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prox1P48437 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prox1P48437 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prox1P48437 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms