Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcd1P48410 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcd1P48410 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms