Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VdrP48281 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VdrP48281 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VdrP48281 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VdrP48281 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VdrP48281 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VdrP48281 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VdrP48281 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VdrP48281 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VdrP48281 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VdrP48281 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VdrP48281 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VdrP48281 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VdrP48281 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VdrP48281 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VdrP48281 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VdrP48281 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VdrP48281 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VdrP48281 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms