Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl5P47962 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms