Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capza1P47753 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capza1P47753 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capza1P47753 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capza1P47753 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capza1P47753 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capza1P47753 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capza1P47753 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capza1P47753 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capza1P47753 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capza1P47753 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capza1P47753 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capza1P47753 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capza1P47753 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capza1P47753 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capza1P47753 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capza1P47753 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capza1P47753 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capza1P47753 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capza1P47753 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capza1P47753 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capza1P47753 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms