Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf1P46099 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf1P46099 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf1P46099 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf1P46099 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms