Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms