Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NodalP43021 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NodalP43021 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NodalP43021 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NodalP43021 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NodalP43021 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NodalP43021 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NodalP43021 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NodalP43021 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NodalP43021 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NodalP43021 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NodalP43021 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NodalP43021 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NodalP43021 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NodalP43021 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NodalP43021 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NodalP43021 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NodalP43021 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NodalP43021 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NodalP43021 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms