Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkx2-2P42586 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms