Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3caP42337 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3caP42337 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms