Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms