Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd1P40201 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd1P40201 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd1P40201 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd1P40201 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chd1P40201 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd1P40201 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd1P40201 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd1P40201 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd1P40201 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd1P40201 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chd1P40201 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd1P40201 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd1P40201 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd1P40201 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms