Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprkP35822 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PtprkP35822 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprkP35822 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprkP35822 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprkP35822 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprkP35822 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PtprkP35822 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PtprkP35822 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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