Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc5P35689 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc5P35689 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms