Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab20P35295 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab20P35295 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab20P35295 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab20P35295 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab20P35295 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms