Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx2P31316 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx2P31316 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx2P31316 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx2P31316 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx2P31316 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx2P31316 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx2P31316 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx2P31316 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx2P31316 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx2P31316 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx2P31316 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx2P31316 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx2P31316 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx2P31316 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx2P31316 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx2P31316 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsx2P31316 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsx2P31316 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsx2P31316 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gsx2P31316 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsx2P31316 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsx2P31316 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsx2P31316 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsx2P31316 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsx2P31316 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsx2P31316 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gsx2P31316 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gsx2P31316 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gsx2P31316 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gsx2P31316 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gsx2P31316 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gsx2P31316 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gsx2P31316 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gsx2P31316 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms