Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc11P31313 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms