Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VtnP29788 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VtnP29788 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VtnP29788 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VtnP29788 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VtnP29788 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VtnP29788 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VtnP29788 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VtnP29788 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VtnP29788 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VtnP29788 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VtnP29788 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VtnP29788 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VtnP29788 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VtnP29788 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VtnP29788 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VtnP29788 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VtnP29788 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VtnP29788 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VtnP29788 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VtnP29788 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VtnP29788 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VtnP29788 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VtnP29788 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VtnP29788 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VtnP29788 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VtnP29788 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VtnP29788 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VtnP29788 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VtnP29788 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VtnP29788 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VtnP29788 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VtnP29788 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VtnP29788 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VtnP29788 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VtnP29788 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VtnP29788 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VtnP29788 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VtnP29788 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VtnP29788 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VtnP29788 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VtnP29788 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VtnP29788 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms