Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CtgfP29268 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtgfP29268 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtgfP29268 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CtgfP29268 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtgfP29268 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CtgfP29268 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtgfP29268 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtgfP29268 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CtgfP29268 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtgfP29268 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms