Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprmP28828 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprmP28828 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprmP28828 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprmP28828 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprmP28828 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprmP28828 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprmP28828 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprmP28828 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprmP28828 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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