Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Etv4P28322 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms