Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd12P23812 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms