Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tap1P21958 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tap1P21958 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tap1P21958 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tap1P21958 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tap1P21958 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms