Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms