Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnnc2P20801 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnnc2P20801 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms