Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb9P20615 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms